Установка:
Для установки r-bioc-ensembldb в Ubuntu / Linux Mint / Debian, введите в Терминал:
Подробная информация о пакете:
Утилиты GNU R для создания и использования базы данных аннотаций, основанной на Ensembl
-
Зависимости:
-
GNU R ядро статистической вычислительной и графической системы
-
GNU R Интерфейс базы данных аннотаций для BioConductor
-
Средства для фильтрации ресурсов аннотации Bioconductor
-
Клиент GNU R для доступа к ресурсам AnnotationHub
-
Базовые функции для Bioconductor
-
Общие функции для Bioconductor
-
Строковые объекты GNU R, представляющие биологические последовательности
-
Утилиты BioConductor для управления хромосомными идентификаторами
-
Инструменты GNU R для создания и обработки стандартных аннотаций транскрипции
-
Представление BioConductor и манипуляция геномными интервалами
-
Контейнеры низкого уровня GNU R для хранения наборов целых диапазонов
-
S4 общие функции для инфраструктуры протеомики Bioconductor
-
GNU R двоичное выравнивание (BAM), вариант вызова (BCF) или импорт файла tabix
-
Интерфейс GNU R для браузеров генома и их аннотации
-
BioConductor S4 реализация векторов и списков
-
Современный и гибкий веб-клиент GNU R для R
-
Пакет GNU R, обеспечивающий общий интерфейс базы данных
-
Драйвер интерфейса базы данных R для SQLite
-
r-api-3.4