Установка chimeraslayer в Ubuntu / Linux Mint / Debian

Установка:

Для установки chimeraslayer в Ubuntu / Linux Mint / Debian, введите в Терминал:

sudo apt update

sudo apt install chimeraslayer

Выберите действие:

Установить

Переустановить

Удалить пакет

Удалить пакет со всеми настройками

Дополнительные опции:

Автоподтверждение действий [-y]

Исправить зависимости пакета [-f]

Установить только обязательные пакеты [--no-install-recommends]

Обнаруживает вероятные химеры в ПЦР-амплифицированной ДНК

http://microbiomeutil.sourceforge.net/

Сентябрь 2018 Источник: packages.ubuntu.com

Зависимости:
blast2

Переходный фиктивный пакет к ncbi-blast + -legacy
cdbfasta

Инструменты индексирования и извлечения констант DataBase для файлов с несколькими файлами FASTA
microbiomeutil-data

Ссылка 16S последовательностей и NAST-выравниваний, используемых микробиотомитильными инструментами