» Наука

Как установить kraken в Ubuntu / Debian

Установка:

Для установки kraken в Ubuntu / Linux Mint / Debian, введите в Терминал:

sudo apt update
sudo apt install kraken

Настроить команду APT

kraken — присвоение таксономических меток коротким последовательностям ДНК

Подробная информация о пакете:

Присвоение таксономических меток коротким последовательностям ДНК

http://ccb.jhu.edu/software/kraken/
Источник: packages.ubuntu.com

  • Зависимости:

  • jellyfish1

    Подсчет k-mers в последовательностях ДНК

  • libc6

    Библиотека GNU C: общие библиотеки

  • libgcc1

    Библиотека поддержки GCC

  • libgomp1

    Библиотека поддержки GCC OpenMP (GOMP)

  • libstdc++6