Установка velvetoptimiser в Ubuntu / Linux Mint / Debian

Установка:

Для установки velvetoptimiser в Ubuntu / Linux Mint / Debian, введите в Терминал:

sudo apt update

sudo apt install velvetoptimiser

Выберите действие:

Установить

Переустановить

Удалить пакет

Удалить пакет со всеми настройками

Дополнительные опции:

Автоподтверждение действий [-y]

Исправить зависимости пакета [-f]

Установить только обязательные пакеты [--no-install-recommends]

Автоматически оптимизировать параметры сборки Velvet do novo

https://github.com/tseemann/VelvetOptimiser/

Май 2018 Источник: packages.ubuntu.com

Зависимости:
bioperl

Инструменты Perl для вычислительной молекулярной биологии
velvet

Ассемблер последовательности нуклеиновой кислоты для очень коротких прочтений