Установка:

Для установки assemblytics в Ubuntu / Linux Mint, введите в Терминал:

sudo apt update
sudo apt install assemblytics
Dzen
assemblytics — выявлять и анализировать структурные варианты из сборки генома

Подробная информация о пакете:

Выявлять и анализировать структурные варианты из сборки генома

  • Зависимости:

  • perl

    Практический язык извлечения и отчета Ларри Уолла

  • python

    Интерактивный высокоуровневый объектно-ориентированный язык (ветка 2.x)

  • python-numpy

    Численный Python добавляет быстрый механизм массива на язык Python

  • r-base-core

    GNU R ядро ​​статистической вычислительной и графической системы

  • r-cran-ggplot2

    Реализация грамматики графики

  • r-cran-plyr

    Инструменты для разделения, применения и объединения данных

  • r-cran-rcolorbrewer

    Комплект GNU R, обеспечивающий подходящие цветовые палитры