Установка beagle в Ubuntu / Linux Mint / Debian

Установка:

Для установки beagle в Ubuntu / Linux Mint / Debian, введите в Терминал:

sudo apt update

sudo apt install beagle

Выберите действие:

Установить

Переустановить

Удалить пакет

Удалить пакет со всеми настройками

Дополнительные опции:

Автоподтверждение действий [-y]

Исправить зависимости пакета [-f]

Установить только обязательные пакеты [--no-install-recommends]

Вызов генотипа, фазирование генотипа и вменение негенотипированных маркеров

https://faculty.washington.edu/browning/beagle/beagle.html

Октябрь 2018 Источник: packages.ubuntu.com

Зависимости:
default-jre

Стандартная совместимость с Java или Java Runtime
jarwrapper

Выполнять исполняемые файлы Java .jar
libhtsjdk-java

Java API для форматов данных с высокой пропускной способностью (HTS)
java8-runtime
java9-runtime
java10-runtime
java11-runtime