» Наука

Как установить centrifuge в Ubuntu

Установка:

Для установки centrifuge в Ubuntu / Linux Mint, введите в Терминал:

sudo apt update
sudo apt install centrifuge

Настроить команду APT

centrifuge — быстрая и эффективная с точки зрения памяти система для классификации последовательностей ДНК

Подробная информация о пакете:

Быстрая и эффективная с точки зрения памяти система для классификации последовательностей ДНК

https://ccb.jhu.edu/software/centrifuge/
Источник: packages.ubuntu.com

  • Зависимости:

  • hisat2

    Графическое выравнивание короткого нуклеотида читается во многих геномах

  • jellyfish

    Подсчет k-mers в последовательностях ДНК

  • libc6

    Библиотека GNU C: общие библиотеки

  • libgcc1

    Библиотека поддержки GCC

  • python

    Интерактивный высокоуровневый объектно-ориентированный язык (ветка 2.x)

  • libstdc++6