» Наука

Как установить deepnano в Ubuntu

Установка:

Для установки deepnano в Ubuntu / Linux Mint, введите в Терминал:

sudo apt update
sudo apt install deepnano

Настроить команду APT

deepnano — альтернативный basecaller для чтения Minion геномных последовательностей

Подробная информация о пакете:

Альтернативный basecaller для чтения Minion геномных последовательностей

https://bitbucket.org/vboza/deepnano
Источник: packages.ubuntu.com

  • Зависимости:

  • deepnano-data

    Альтернативный basecaller для чтения MinION геномных последовательностей (данных)

  • libc6

    Библиотека GNU C: общие библиотеки

  • libgcc1

    Библиотека поддержки GCC

  • python

    Интерактивный высокоуровневый объектно-ориентированный язык (ветка 2.x)

  • python-dateutil

    Мощные расширения стандартного модуля datetime

  • python-h5py

    Универсальный интерфейс Python для hdf5 (Python 2)

  • python-numpy

    Численный Python добавляет быстрый механизм массива на язык Python

  • python-theano

    Компилятор math-выражения CPU/GPU для Python

  • libstdc++6