» Наука

Как установить hinge в Ubuntu

Установка:

Для установки hinge в Ubuntu / Linux Mint, введите в Терминал:

sudo apt update
sudo apt install hinge

Настроить команду APT

hinge — долгое чтение ассемблера генома на основе шарнира

Подробная информация о пакете:

Долгое чтение ассемблера генома на основе шарнира

https://github.com/HingeAssembler/HINGE
Источник: packages.ubuntu.com

  • Зависимости:

  • daligner

    Обнаружение локального выравнивания между длинным нуклеотидным секвенированием

  • dascrubber

    Расчётный конвейер для выравнивания ДНК

  • dazzdb

    Данные считывания последовательности нуклеотидов

  • libc6

    Библиотека GNU C: общие библиотеки

  • libgcc1

    Библиотека поддержки GCC

  • libgomp1

    Библиотека поддержки GCC OpenMP (GOMP)

  • python

    Интерактивный высокоуровневый объектно-ориентированный язык (ветка 2.x)

  • python-colormap

    Легко манипулировать цветовыми картами matplotlib и цветными кодеками (Python 2)

  • python-configparser

    Backport расширенного конфигурационного анализатора, представленного в Python 3.2

  • python-matplotlib

    Система построения на основе Python в стиле, подобном Matlab

  • python-networkx

    Инструмент для создания, управления и изучения сложных сетей

  • python-numpy

    Численный Python добавляет быстрый механизм массива на язык Python

  • python-pbcore

    Библиотека Python для обработки файлов данных PacBio

  • python-ujson

    Ультра быстрый JSON-кодер и декодер для Python 2

  • zlib1g

    Библиотека сжатия - время выполнения

  • libstdc++6