Установка:
Для установки iva в Ubuntu / Linux Mint / Debian, введите в Терминал:
sudo apt update
sudo apt install iva
Подробная информация о пакете:
Ассемблер итеративной вирусной последовательности
-
Зависимости:
-
Стандартная совместимость с Java или Java Runtime (без звука)
-
Инструменты FASTA и FASTQ для работы с файлами
-
Счетчики в геномных последовательностях
-
Эффективное выравнивание последовательности полных геномов
-
Интерактивный высокоуровневый объектно-ориентированный язык (версия python3 по умолчанию)
-
Инструмент для создания, управления и изучения сложных сетей (Python3)
-
Быстрое создание массива на языке Python 3
-
Интерфейс для выравнивания и отображения последовательности SAM / BAM (Python 3)
-
Выравнивание последовательности обработки в форматах SAM и BAM
-
Инструмент сопоставления последовательностей и выравнивания