Установка kmer в Ubuntu / Linux Mint / Debian

Установка:

Для установки kmer в Ubuntu / Linux Mint / Debian, введите в Терминал:

sudo apt update

sudo apt install kmer

Выберите действие:

Установить

Переустановить

Удалить пакет

Удалить пакет со всеми настройками

Дополнительные опции:

Автоподтверждение действий [-y]

Исправить зависимости пакета [-f]

Установить только обязательные пакеты [--no-install-recommends]

Набор инструментов для анализа последовательности ДНК

http://kmer.sourceforge.net

Август 2018 Источник: packages.ubuntu.com

Зависимости:
atac

Сравнение сборки генома
leaff

Утилиты библиотек биологической последовательности и приложения
meryl

Подсчет и утилиты подсчета и подсчета
sim4db

Пакетное сращивание выравнивания последовательностей кДНК с целевым геномом