» Наука

Как установить mapdamage в Ubuntu / Debian

Установка:

Для установки mapdamage в Ubuntu / Linux Mint / Debian, введите в Терминал:

sudo apt update
sudo apt install mapdamage

Настроить команду APT

mapdamage — отслеживание и количественное определение структур повреждений в древних последовательностях ДНК

Подробная информация о пакете:

Отслеживание и количественное определение структур повреждений в древних последовательностях ДНК

https://ginolhac.github.io/mapDamage/
Источник: packages.ubuntu.com

  • Зависимости:

  • libopenblas-dev

    Оптимизированная библиотека BLAS (линейная алгебра) (файлы разработки)

  • libblas-dev

    Основные подпрограммы линейной алгебры 3, статическая библиотека

  • libatlas-base-dev

    Автоматически настроенное программное обеспечение линейной алгебры, общий статический

  • liblapack-dev

    Библиотека линейных алгоритмов 3 - статическая версия

  • python

    Интерактивный высокоуровневый объектно-ориентированный язык (ветка 2.x)

  • python-pysam

    Интерфейс для выравнивания и отображения последовательности SAM / BAM (Python 2)

  • r-base-core

    GNU R ядро ​​статистической вычислительной и графической системы

  • r-cran-gam

    Обобщенные аддитивные модели для R

  • r-cran-ggplot2

    Реализация грамматики графики

  • r-cran-inline

    GNU R для встроенных функций C, C++, Fortran из R

  • r-cran-rcpp

    GNU R пакет для бесшовной интеграции R и C++

  • r-cran-rcppgsl

    GNU R для интеграции с GNU GSL

  • seqtk

    Быстрый и легкий инструмент для обработки последовательностей в формате FASTA или FASTQ

  • libblas.so

  • liblapack.so