» Наука

Как установить metaphlan2 в Ubuntu / Debian

Установка:

Для установки metaphlan2 в Ubuntu / Linux Mint / Debian, введите в Терминал:

sudo apt update
sudo apt install metaphlan2

Настроить команду APT

metaphlan2 — Метагеномический филогенетический анализ

Подробная информация о пакете:

Метагеномический филогенетический анализ

https://bitbucket.org/biobakery/metaphlan2
Источник: packages.ubuntu.com

  • Зависимости:

  • bowtie2

    Ультрабыстрое запоминающее устройство с коротким считыванием

  • metaphlan2-data

    Пакет данных для метагеномного филогенетического анализа

  • python

    Интерактивный высокоуровневый объектно-ориентированный язык (ветка 2.x)

  • python-biom-format

    Формат матрицы биологического наблюдения (BIOM) (Python 2)

  • python-msgpack

    Реализация формата MessagePack на Python

  • python-pandas

    Структуры данных для «реляционных» или «помеченных» данных