Установка:

Для установки predictprotein в Ubuntu / Linux Mint / Debian, введите в Терминал:

sudo apt update
sudo apt install predictprotein

Настроить команду APT

predictprotein — набор инструментов анализа последовательности белка

Подробная информация о пакете:

Набор инструментов анализа последовательности белка

  • Зависимости:

  • bioperl

    Инструменты Perl для вычислительной молекулярной биологии

  • blast2

    Переходный фиктивный пакет к ncbi-blast + -legacy

  • disulfinder

    Состояние дисульфидного связывания цистеинов и предиктор соединения

  • hmmer

    Профильные скрытые марковские модели для анализа последовательности белка

  • hmmer2

    Профильные скрытые марковские модели для анализа последовательности белка

  • librg-exception-perl

    Модуль RG :: Exception Perl

  • librg-utils-perl

    Анализаторы и утилиты преобразования формата, используемые (например,) profphd

  • make

    Утилита для управления компиляцией

  • metastudent

    Предсказатель терминов генных онтологий из последовательности белка

  • ncbi-seg

    Инструмент для маскирования сегментов с низкой композиционной сложностью в аминокислотных последовательностях

  • ncoils

    Предсказание вторичной структуры спиральной катушки

  • norsnet

    Инструмент для определения неструктурированных петель в белках

  • norsp

    Предиктор нерегулярной вторичной структуры

  • perl

    Практический язык извлечения и отчета Ларри Уолла

  • predictnls

    Прогнозирование и анализ сигналов ядерной локализации белка

  • profbval

    Предиктор остатков гибкого / ригидного белка из последовательности

  • profisis

    Предсказание сайтов взаимодействия белка и белка от последовательности

  • profphd

    Предиктор доступности вторичной структуры и растворителя

  • proftmb

    Предсказание пробы бактериальных трансмембранных бета-бочек

  • reprof

    Вторичная структура белка и предиктор доступности