Установка:
Для установки roary в Ubuntu / Linux Mint / Debian, введите в Терминал:
Подробная информация о пакете:
Высокоскоростной автономный контур генома генома
-
Зависимости:
-
Набор утилит для сравнения геномных функций
-
Инструменты Perl для вычислительной молекулярной биологии
-
Набор программ, предназначенных для быстрой группировки последовательностей
-
Филогенетические деревья от выравнивания нуклеотидных или белковых последовательностей
-
Сбор небольших утилов для манипуляции массивами
-
Расширение Perl для получения сумм MD5 для файлов и URL-адресов
-
Модуль Perl, реализующий расширенные операции над переменными пути
-
Модуль, который позволяет вам объявлять реальные классы исключений в Perl
-
Модуль для поиска файлов на основе правил
-
Модуль для сопоставления шаблонов в серии файлов
-
Простой, нормальный и эффективный модуль для удаления файла
-
Модуль Perl для поиска путей для исполняемых программ
-
Perl-модуль для использования относительного пути для каталогов lib
-
Модуль Perl для структур и алгоритмов графа
-
Модуль для чтения и записи ориентированных графов
-
Порт Perl широко популярного log4j logging package
-
Современная инфраструктура объектной системы Perl
-
Быстрый и правильный модуль UTF-8 Perl IO
-
Модуль Perl для проверки атрибутов файлов
-
Модуль для облегчения тестирования с файлами и каталогами
-
Модуль Perl с наиболее необходимыми функциями и функциями тестирования
-
Perl для тестирования сообщений stdout и stderr
-
Разделитель значений с запятыми (с использованием XS или PurePerl)
-
Программа множественного выравнивания для аминокислотных или нуклеотидных последовательностей
-
Марковский алгоритм кластера
-
Набор инструментов следующего поколения BLAST
-
Создавать и выполнять командные строки со стандартного ввода параллельно
-
Практический язык извлечения и отчета Ларри Уолла
-
Набор вероятностного выравнивания для последовательностей ДНК, кодонов и аминокислот
-
GNU R ядро статистической вычислительной и графической системы
-
Реализация грамматики графики