» Наука

Как установить rsem в Ubuntu / Debian

Установка:

Для установки rsem в Ubuntu / Linux Mint / Debian, введите в Терминал:

sudo apt update
sudo apt install rsem

Настроить команду APT

rsem — RNA-Seq по ожиданию-максимизации

Подробная информация о пакете:

RNA-Seq по ожиданию-максимизации

http://deweylab.biostat.wisc.edu/rsem/
Источник: packages.ubuntu.com

  • Зависимости:

  • bowtie

    Ультрабыстрое быстродействующее короткое считывающее устройство

  • bowtie2

    Ультрабыстрое запоминающее устройство с коротким считыванием

  • libc6

    Библиотека GNU C: общие библиотеки

  • libgcc1

    Библиотека поддержки GCC

  • perl

    Практический язык извлечения и отчета Ларри Уолла

  • python

    Интерактивный высокоуровневый объектно-ориентированный язык (ветка 2.x)

  • r-base-core

    GNU R ядро ​​статистической вычислительной и графической системы

  • zlib1g

    Библиотека сжатия - время выполнения

  • libstdc++6