Установка:
Для установки srst2 в Ubuntu / Linux Mint / Debian, введите в Терминал:
Подробная информация о пакете:
Короткое чтение последовательности для бактериальных патогенов
-
Зависимости:
-
Ультрабыстрое запоминающее устройство с коротким считыванием
-
Набор программ, предназначенных для быстрой группировки последовательностей
-
Интерактивный высокоуровневый объектно-ориентированный язык (ветка 2.x)
-
Библиотека Python для биоинформатики (реализована на Python 2)
-
Научные инструменты для Python
-
Выравнивание последовательности обработки в форматах SAM и BAM