Установка:

Для установки stacks в Ubuntu / Linux Mint / Debian, введите в Терминал:

sudo apt update
sudo apt install stacks
stacks — конвейер для построения локусов из короткочитаемых последовательностей ДНК

Подробная информация о пакете:

Конвейер для построения локусов из короткочитаемых последовательностей ДНК

  • Зависимости:

  • libc6

    Библиотека GNU C: общие библиотеки

  • libdbi-perl

    Интерфейс базы данных Perl (DBI)

  • libgcc1

    Библиотека поддержки GCC

  • libgomp1

    Библиотека поддержки GCC OpenMP (GOMP)

  • libhts2

    Библиотека C для форматов данных с высокой пропускной способностью

  • libstdc++6

    Стандартная библиотека GNU GNU v3

  • python

    Интерактивный высокоуровневый объектно-ориентированный язык (ветка 2.x)

  • samtools

    Выравнивание последовательности обработки в форматах SAM и BAM

  • zlib1g

    Библиотека сжатия - время выполнения