Установка:
Для установки tophat в Ubuntu / Linux Mint / Debian, введите в Терминал:
sudo apt update
sudo apt install tophat
Подробная информация о пакете:
Быстрый склейка карт для чтения RNA-Seq
-
Зависимости:
-
Ультрабыстрое запоминающее устройство с коротким считыванием
-
Ультрабыстрое быстродействующее короткое считывающее устройство
-
Библиотека операционной системы (например, поддержка диагностики)
-
Портативный многопоточный C++
-
Библиотека GNU C: общие библиотеки
-
Библиотека поддержки GCC
-
Интерактивный высокоуровневый объектно-ориентированный язык (ветка 2.x)
-
Выравнивание последовательности обработки в форматах SAM и BAM
-
Библиотека сжатия - время выполнения
-
libstdc++6