Установка:
Для установки bio-tradis в Ubuntu / Linux Mint, введите в Терминал:
sudo apt update
sudo apt install bio-tradis
Подробная информация о пакете:
Анализировать результаты анализа TraDIS геномных последовательностей
-
Зависимости:
-
Практический язык извлечения и отчета Ларри Уолла
-
GNU R ядро статистической вычислительной и графической системы
-
Пакет GNU R, обеспечивающий функциональность синтаксического анализа командной строки
-
GNU R-пакет Venables и Ripley's MASS
-
Выравнивание последовательности обработки в форматах SAM и BAM
-
Инструмент сопоставления последовательностей и выравнивания
-
Универсальный индексатор для файлов положения генома, разделенных TAB