Установка:

Для установки chado-utils в Ubuntu / Linux Mint / Debian, введите в Терминал:

sudo apt update
sudo apt install chado-utils
chado-utils — инструменты для добавления / выделения данных из Chado

Подробная информация о пакете:

Инструменты для добавления / выделения данных из Chado

Этот пакет содержит несколько инструментов, которые можно использовать для извлечения данных из базы данных Chado или подготовки данных перед загрузкой. Это подмножество над схемой и библиотеками базы данных Chado.

Chado — это схема реляционной базы данных, которая лежит в основе многих установок GMOD. Он способен отображать многие общие классы данных, которые часто встречаются в современной биологии, такие как последовательность, сравнение последовательностей, фенотипы, генотипы, онтологии, публикации и филогения.

  • Зависимости:

  • libchado-perl

    Схема базы данных и инструменты для геномных данных

  • perl

    Практический язык извлечения и отчета Ларри Уолла