Установка:

Для установки khmer в Ubuntu / Linux Mint / Debian, введите в Терминал:

sudo apt update
sudo apt install khmer
khmer — подсчет, фильтрация и обход диаграммы ДНК в памяти

Подробная информация о пакете:

Подсчет, фильтрация и обход диаграммы ДНК в памяти

  • Зависимости:

  • cython3

    C-расширения для Python 3

  • khmer-common

    Общие файлы для инструментов кхмера

  • libbz2-1.0

    Высококачественная блочная библиотека сортировки файлов - время выполнения

  • libc6

    Библиотека GNU C: общие библиотеки

  • libgcc1

    Библиотека поддержки GCC

  • libgomp1

    Библиотека поддержки GCC OpenMP (GOMP)

  • libstdc++6

    Стандартная библиотека GNU GNU v3

  • python3

    Интерактивный высокоуровневый объектно-ориентированный язык (версия python3 по умолчанию)

  • python3-bz2file

    Библиотека Python3 для чтения и записи bzip2-сжатых файлов

  • python3-screed

    Краткие нуклеотидные последовательности считывания в Python 3

  • zlib1g

    Библиотека сжатия - время выполнения