» Python

Как установить python-pbalign в Ubuntu / Debian

Установка:

Для установки python-pbalign в Ubuntu / Linux Mint / Debian, введите в Терминал:

sudo apt update
sudo apt install python-pbalign
Dzen
python-pbalign — карта Pacific Biosciences читает ссылки на последовательности ДНК (Python2)

Подробная информация о пакете:

Карта Pacific Biosciences читает ссылки на последовательности ДНК (Python2)

https://github.com/PacificBiosciences/pbalign
Источник: packages.ubuntu.com

  • Зависимости:

  • blasr

    Отображение одномолекулярных последовательностей

  • python

    Интерактивный высокоуровневый объектно-ориентированный язык (ветка 2.x)

  • python-pbcommand

    Общий интерфейс командной строки для модулей анализа Pacific Biosciences

  • python-pbcore

    Библиотека Python для обработки файлов данных PacBio

  • python-pysam

    Интерфейс для выравнивания и отображения последовательности SAM / BAM (Python 2)