Установка:

Для установки smrtanalysis-dev в Ubuntu / Linux Mint / Debian, введите в Терминал:

sudo apt update
sudo apt install smrtanalysis-dev
smrtanalysis-dev — библиотеки разработки для smttanalysis

Подробная информация о пакете:

Библиотеки разработки для smttanalysis

  • Зависимости:

  • libpbbam-dev

    Библиотека бинарного выравнивания / карты Pacific Biosciences (BAM) (заголовки)

  • libpbseq-dev

    Библиотека для анализа данных секвенирования PacBio (файлы разработки)

  • python-kineticstools

    Обнаружение модификаций ДНК (библиотека Python 2)

  • python-pbalign

    Карта Pacific Biosciences читает ссылки на последовательности ДНК (Python2)

  • python-pbcommand

    Общий интерфейс командной строки для модулей анализа Pacific Biosciences

  • python-pbconsensuscore

    Алгоритмы для множественной последовательности PacBio - Python 2

  • python3-pbconsensuscore

    Алгоритмы для множественной последовательности PacBio - Python 3

  • python-pbcore

    Библиотека Python для обработки файлов данных PacBio

  • python-pbgenomicconsensus

    Вариант Pacific Biosciences и консенсус-звонящий (Python 2)

  • python-pbh5tools

    Инструменты для управления файлами HDF5 Pacific Biosciences - библиотека Python 2