Установка:
Для установки smrtanalysis-dev в Ubuntu / Linux Mint / Debian, введите в Терминал:
Подробная информация о пакете:
Библиотеки разработки для smttanalysis
-
Зависимости:
-
Библиотека бинарного выравнивания / карты Pacific Biosciences (BAM) (заголовки)
-
Библиотека для анализа данных секвенирования PacBio (файлы разработки)
-
Обнаружение модификаций ДНК (библиотека Python 2)
-
Карта Pacific Biosciences читает ссылки на последовательности ДНК (Python2)
-
Общий интерфейс командной строки для модулей анализа Pacific Biosciences
-
Алгоритмы для множественной последовательности PacBio - Python 2
-
Алгоритмы для множественной последовательности PacBio - Python 3
-
Библиотека Python для обработки файлов данных PacBio
-
Вариант Pacific Biosciences и консенсус-звонящий (Python 2)
-
Инструменты для управления файлами HDF5 Pacific Biosciences - библиотека Python 2