Установка:

Для установки r-bioc-biomformat в Ubuntu / Linux Mint / Debian, введите в Терминал:

sudo apt update
sudo apt install r-bioc-biomformat
r-bioc-biomformat — Интерфейсный пакет GNU R для формата файла BIOM

Подробная информация о пакете:

Интерфейсный пакет GNU R для формата файла BIOM

Это пакет R для взаимодействия с форматом BIOM. Этот пакет включает базовые инструменты для чтения файлов формата biom, доступа и подмножества таблиц данных из объекта biom (который более сложный, чем одна таблица), а также ограниченная поддержка для записи объекта biom обратно в файл формата biom , Дизайн этого API предназначен для соответствия API Python и других инструментов, включенных в проект biom-format, но с явно «R-ароматом», который должен быть знаком пользователям R. Это включает в себя классы и методы S4, а также расширения общих основных функций / методов.

  • Зависимости:

  • r-base-core

    GNU R ядро ​​статистической вычислительной и графической системы

  • r-cran-jsonlite

    Прочный, высокопроизводительный анализатор JSON и генератор для R

  • r-cran-matrix

    Набор классов GNU R для плотных и разреженных матриц

  • r-cran-plyr

    Инструменты для разделения, применения и объединения данных

  • r-api-3.4