Установка:

Для установки r-bioc-deseq2 в Ubuntu / Linux Mint / Debian, введите в Терминал:

sudo apt update
sudo apt install r-bioc-deseq2
r-bioc-deseq2 — R для анализа дифференциального выражения RNA-Seq

Подробная информация о пакете:

R для анализа дифференциального выражения RNA-Seq

  • Зависимости:

  • libc6

    Библиотека GNU C: общие библиотеки

  • libgcc1

    Библиотека поддержки GCC

  • liblapack3

    Библиотека линейных алгоритмов 3 - общая версия

  • libstdc++6

    Стандартная библиотека GNU GNU v3

  • r-base-core

    GNU R ядро ​​статистической вычислительной и графической системы

  • r-bioc-biobase

    Базовые функции для Bioconductor

  • r-bioc-biocgenerics

    Общие функции для Bioconductor

  • r-bioc-biocparallel

    Объекты BioConductor для параллельной оценки

  • r-bioc-genefilter

    Методы фильтрации генов из микрочиповых экспериментов

  • r-bioc-geneplotter

    R для построения геномных данных

  • r-bioc-genomicranges

    Представление BioConductor и манипуляция геномными интервалами

  • r-bioc-iranges

    Контейнеры низкого уровня GNU R для хранения наборов целых диапазонов

  • r-bioc-s4vectors

    BioConductor S4 реализация векторов и списков

  • r-bioc-summarizedexperiment

    Контейнер для анализа BioConductor

  • r-cran-ggplot2

    Реализация грамматики графики

  • r-cran-hmisc

    Функции GNU R от Фрэнка Харрелла

  • r-cran-rcpp

    GNU R пакет для бесшовной интеграции R и C++

  • libblas3

  • libblas.so.3

  • liblapack.so.3

  • r-api-3.4