Установка:

Для установки r-bioc-genomicranges в Ubuntu / Linux Mint / Debian, введите в Терминал:

sudo apt update
sudo apt install r-bioc-genomicranges

Подробная информация о пакете:

Представление BioConductor и манипуляция геномными интервалами

Способность эффективно хранить геномные аннотации и выравнивания играет центральную роль, когда дело доходит до анализа данных с высокой пропускной способностью (данные NGS от a.k.a.). Пакет определяет контейнеры общего назначения для хранения геномных интервалов, а также более специализированные контейнеры для хранения выравниваний по отношению к эталонному геному.

Зависимости:

  • libc6

  • r-api-3.4

  • r-base-core

    GNU R ядро ​​статистической вычислительной и графической системы

  • r-bioc-biocgenerics

    общие функции для Bioconductor

  • r-bioc-genomeinfodb

    Утилиты BioConductor для управления хромосомными идентификаторами

  • r-bioc-iranges

    Контейнеры низкого уровня GNU R для хранения наборов целых диапазонов

  • r-bioc-s4vectors

    BioConductor S4 реализация векторов и списков

  • r-bioc-xvector

    Представление BioConductor и манипуляция внешними последовательностями