Установка:

Для установки r-bioc-phyloseq в Ubuntu / Linux Mint / Debian, введите в Терминал:

sudo apt update
sudo apt install r-bioc-phyloseq
Dzen
r-bioc-phyloseq — Обработка GNU R и анализ данных переписи микробиомов с высокой пропускной способностью

Подробная информация о пакете:

Обработка GNU R и анализ данных переписи микробиомов с высокой пропускной способностью

  • Зависимости:

  • r-base-core

    GNU R ядро ​​статистической вычислительной и графической системы

  • r-bioc-biobase

    Базовые функции для Bioconductor

  • r-bioc-biocgenerics

    Общие функции для Bioconductor

  • r-bioc-biomformat

    Интерфейсный пакет GNU R для формата файла BIOM

  • r-bioc-biostrings

    Строковые объекты GNU R, представляющие биологические последовательности

  • r-bioc-multtest

    Множественное тестирование гипотез на основе передискретизации Bioconductor

  • r-cran-ade4

    Анализ экологических данных GNU R

  • r-cran-ape

    Пакет GNU R для анализа филогенетики и эволюции

  • r-cran-cluster

    GNU R для кластерного анализа Rousseeuw et al.

  • r-cran-data.table

    Расширение GNU R Data.frame

  • r-cran-foreach

    Поддержка GNU R foreach

  • r-cran-ggplot2

    Реализация грамматики графики

  • r-cran-igraph

    Сетевой анализ и визуализация GNU R

  • r-cran-plyr

    Инструменты для разделения, применения и объединения данных

  • r-cran-reshape2

    Гибкая переформатирование данных: перезагрузка пакета изменения

  • r-cran-scales

    Масштабные функции для визуализации

  • r-cran-vegan

    Пакет экологического сообщества для R

  • r-api-3.4