» Наука

Как установить qcumber в Ubuntu

Установка:

Для установки qcumber в Ubuntu / Linux Mint, введите в Терминал:

sudo apt update
sudo apt install qcumber

Настроить команду APT

qcumber — контроль качества геномных последовательностей

Подробная информация о пакете:

Контроль качества геномных последовательностей

https://gitlab.com/RKIBioinformaticsPipelines/QCumber
Источник: packages.ubuntu.com

  • Зависимости:

  • debconf

    Система управления конфигурацией Debian

  • libjs-angularjs

    Позволяет писать клиентские веб-приложения, как если бы у вас был более умный браузер

  • libjs-bootstrap

    HTML, CSS и JS framework

  • libjs-d3

    Библиотека визуализации JavaScript для HTML и SVG

  • libjs-jquery

    Библиотека JavaScript для динамических веб-приложений

  • python3

    Интерактивный высокоуровневый объектно-ориентированный язык (версия python3 по умолчанию)

  • python3-biopython

    Библиотека Python для биоинформатики (реализована на Python 3)

  • python3-jinja2

    Небольшой, но быстрый и простой в использовании автономный шаблонный движок

  • python3-matplotlib

    Система построения на основе Python в стиле, подобном Matlab (Python 3)

  • r-base-core

    GNU R ядро ​​статистической вычислительной и графической системы

  • r-bioc-savr

    GNU R анализирует и анализирует файлы SAVII Illumina

  • r-cran-ggplot2

    Реализация грамматики графики

  • r-cran-quantreg

    Пакет GNU R для квантильной регрессии

  • debconf-2.0