» Наука

Как установить qiime в Ubuntu

Установка:

Для установки qiime в Ubuntu / Linux Mint, введите в Терминал:

sudo apt update
sudo apt install qiime

Настроить команду APT

qiime — Количественная оценка микробной экологии

Подробная информация о пакете:

Количественная оценка микробной экологии

http://www.qiime.org/
Источник: packages.ubuntu.com

  • Зависимости:

  • fasttree

    Филогенетические деревья от выравнивания нуклеотидных или белковых последовательностей

  • king

    Интерактивная система для трехмерной векторной графики

  • libc6

    Библиотека GNU C: общие библиотеки

  • libffi6

    Время работы библиотеки интерфейса внешней функциональности

  • libgmp10

    Многоточечная арифметическая библиотека

  • libjs-jquery

    Библиотека JavaScript для динамических веб-приложений

  • pynast

    Выравнивание коротких последовательностей ДНК

  • python

    Интерактивный высокоуровневый объектно-ориентированный язык (ветка 2.x)

  • python-biom-format

    Формат матрицы биологического наблюдения (BIOM) (Python 2)

  • python-cogent

    Каркас для геномной биологии

  • python-matplotlib

    Система построения на основе Python в стиле, подобном Matlab

  • python-numpy

    Численный Python добавляет быстрый механизм массива на язык Python

  • python-qcli

    Отдельный модуль pyqi, необходимый для пакета QIIME