Установка:
Для установки smrtanalysis в Ubuntu / Linux Mint / Debian, введите в Терминал:
sudo apt update
sudo apt install smrtanalysis
Подробная информация о пакете:
Программный пакет для одиночной молекулы, в режиме реального времени
-
Зависимости:
-
Отображение одномолекулярных последовательностей
-
Диплоидосохраняющая геномная сборка одномолекулярного секвенирования
-
Обнаружение модификаций ДНК
-
Карта Pacific Biosciences читает ссылки на последовательности ДНК
-
Обработка бинарных файлов выравнивания / карты Pacific Biosciences
-
Аннотировать секвенсирование PacBio с информацией о штрих-кодах
-
Последовательности с использованием ациклических графов
-
Вариант Pacific Biosciences и консенсус
-
Инструменты для управления файлами HDF5 Pacific Biosciences