Установка:
Для установки r-bioc-shortread в Ubuntu / Linux Mint / Debian, введите в Терминал:
Подробная информация о пакете:
Классы и методы GNU R для высокопроизводительных данных с коротким считыванием
-
Зависимости:
-
Библиотека GNU C: общие библиотеки
-
Библиотека поддержки GCC
-
GNU R ядро статистической вычислительной и графической системы
-
Базовые функции для Bioconductor
-
Общие функции для Bioconductor
-
Объекты BioConductor для параллельной оценки
-
Строковые объекты GNU R, представляющие биологические последовательности
-
Утилиты BioConductor для управления хромосомными идентификаторами
-
Представление BioConductor и манипулирование короткими геномными выравниваниями
-
Представление BioConductor и манипуляция геномными интервалами
-
Контейнеры низкого уровня GNU R для хранения наборов целых диапазонов
-
GNU R двоичное выравнивание (BAM), вариант вызова (BCF) или импорт файла tabix
-
BioConductor S4 реализация векторов и списков
-
HTML Writer - выводит объекты R в формате HTML
-
Пакет GNU R для графики Trellis
-
GNU R пакет дополнительных графических дисплеев на основе решетки
-
Библиотека сжатия - время выполнения
-
libstdc++6
-
r-api-3.4