Установка:

Для установки r-bioc-shortread в Ubuntu / Linux Mint / Debian, введите в Терминал:

sudo apt update
sudo apt install r-bioc-shortread
Dzen
r-bioc-shortread — Классы и методы GNU R для высокопроизводительных данных с коротким считыванием

Подробная информация о пакете:

Классы и методы GNU R для высокопроизводительных данных с коротким считыванием

  • Зависимости:

  • libc6

    Библиотека GNU C: общие библиотеки

  • libgcc1

    Библиотека поддержки GCC

  • r-base-core

    GNU R ядро ​​статистической вычислительной и графической системы

  • r-bioc-biobase

    Базовые функции для Bioconductor

  • r-bioc-biocgenerics

    Общие функции для Bioconductor

  • r-bioc-biocparallel

    Объекты BioConductor для параллельной оценки

  • r-bioc-biostrings

    Строковые объекты GNU R, представляющие биологические последовательности

  • r-bioc-genomeinfodb

    Утилиты BioConductor для управления хромосомными идентификаторами

  • r-bioc-genomicalignments

    Представление BioConductor и манипулирование короткими геномными выравниваниями

  • r-bioc-genomicranges

    Представление BioConductor и манипуляция геномными интервалами

  • r-bioc-iranges

    Контейнеры низкого уровня GNU R для хранения наборов целых диапазонов

  • r-bioc-rsamtools

    GNU R двоичное выравнивание (BAM), вариант вызова (BCF) или импорт файла tabix

  • r-bioc-s4vectors

    BioConductor S4 реализация векторов и списков

  • r-cran-hwriter

    HTML Writer - выводит объекты R в формате HTML

  • r-cran-lattice

    Пакет GNU R для графики Trellis

  • r-cran-latticeextra

    GNU R пакет дополнительных графических дисплеев на основе решетки

  • zlib1g

    Библиотека сжатия - время выполнения

  • libstdc++6

  • r-api-3.4