Установка:

Для установки r-bioc-cummerbund в Ubuntu / Linux Mint / Debian, введите в Терминал:

sudo apt update
sudo apt install r-bioc-cummerbund
r-bioc-cummerbund — инструмент для анализа вывода Cufflinks RNA-Seq

Подробная информация о пакете:

Инструмент для анализа вывода Cufflinks RNA-Seq

Позволяет поддерживать постоянное хранение, доступ, исследование и манипулирование данными с высокой пропускной способностью Cufflinks. Кроме того, предоставляет множество функций построения графиков для широко используемых визуализаций.

  • Зависимости:

  • r-base-core

    GNU R ядро ​​статистической вычислительной и графической системы

  • r-bioc-biobase

    Базовые функции для Bioconductor

  • r-bioc-biocgenerics

    Общие функции для Bioconductor

  • r-bioc-gviz

    Построение данных и данных аннотации по геномным координатам

  • r-bioc-rtracklayer

    Интерфейс GNU R для браузеров генома и их аннотации

  • r-bioc-s4vectors

    BioConductor S4 реализация векторов и списков

  • r-cran-fastcluster

    Быстрые иерархические процедуры кластеризации для GNU R

  • r-cran-ggplot2

    Реализация грамматики графики

  • r-cran-plyr

    Инструменты для разделения, применения и объединения данных

  • r-cran-reshape2

    Гибкая переформатирование данных: перезагрузка пакета изменения

  • r-cran-rsqlite

    Драйвер интерфейса базы данных R для SQLite

  • r-api-3.4