» GNU R

Как установить r-bioc-bsgenome в Ubuntu / Debian

Установка:

Для установки r-bioc-bsgenome в Ubuntu / Linux Mint / Debian, введите в Терминал:

sudo apt update
sudo apt install r-bioc-bsgenome
Dzen
r-bioc-bsgenome — Инфраструктура BioConductor для пакетов данных генома на основе Biostrings

Подробная информация о пакете:

Инфраструктура BioConductor для пакетов данных генома на основе Biostrings

https://bioconductor.org/packages/BSgenome/
Источник: packages.ubuntu.com

  • Зависимости:

  • r-base-core

    GNU R ядро ​​статистической вычислительной и графической системы

  • r-bioc-biocgenerics

    Общие функции для Bioconductor

  • r-bioc-biostrings

    Строковые объекты GNU R, представляющие биологические последовательности

  • r-bioc-genomeinfodb

    Утилиты BioConductor для управления хромосомными идентификаторами

  • r-bioc-genomicranges

    Представление BioConductor и манипуляция геномными интервалами

  • r-bioc-iranges

    Контейнеры низкого уровня GNU R для хранения наборов целых диапазонов

  • r-bioc-rsamtools

    GNU R двоичное выравнивание (BAM), вариант вызова (BCF) или импорт файла tabix

  • r-bioc-rtracklayer

    Интерфейс GNU R для браузеров генома и их аннотации

  • r-bioc-s4vectors

    BioConductor S4 реализация векторов и списков

  • r-bioc-xvector

    Представление BioConductor и манипуляция внешними последовательностями

  • r-api-3.4