Установка:
Для установки r-bioc-rtracklayer в Ubuntu / Linux Mint / Debian, введите в Терминал:
Подробная информация о пакете:
Интерфейс GNU R для браузеров генома и их аннотации
-
Зависимости:
-
Библиотека GNU C: общие библиотеки
-
Инструментарий Secure Sockets Layer - общие библиотеки
-
GNU R ядро статистической вычислительной и графической системы
-
Общие функции для Bioconductor
-
Строковые объекты GNU R, представляющие биологические последовательности
-
Утилиты BioConductor для управления хромосомными идентификаторами
-
Представление BioConductor и манипулирование короткими геномными выравниваниями
-
Представление BioConductor и манипуляция геномными интервалами
-
Контейнеры низкого уровня GNU R для хранения наборов целых диапазонов
-
GNU R двоичное выравнивание (BAM), вариант вызова (BCF) или импорт файла tabix
-
BioConductor S4 реализация векторов и списков
-
Представление BioConductor и манипуляция внешними последовательностями
-
GNU R Общая сеть (HTTP/FTP/ ...) клиентский интерфейс
-
GNU R пакет для синтаксического анализа и генерации XML
-
Библиотека сжатия - время выполнения
-
r-api-3.4