Установка:
Для установки r-bioc-biovizbase в Ubuntu / Linux Mint / Debian, введите в Терминал:
Подробная информация о пакете:
Основные графические утилиты GNU R для визуализации геномных данных
-
Зависимости:
-
Библиотека GNU C: общие библиотеки
-
GNU R ядро статистической вычислительной и графической системы
-
GNU R Интерфейс базы данных аннотаций для BioConductor
-
Средства для фильтрации ресурсов аннотации Bioconductor
-
Общие функции для Bioconductor
-
Строковые объекты GNU R, представляющие биологические последовательности
-
Утилиты GNU R для создания и использования базы данных аннотаций, основанной на Ensembl
-
Утилиты BioConductor для управления хромосомными идентификаторами
-
Представление BioConductor и манипулирование короткими геномными выравниваниями
-
Инструменты GNU R для создания и обработки стандартных аннотаций транскрипции
-
Представление BioConductor и манипуляция геномными интервалами
-
Контейнеры низкого уровня GNU R для хранения наборов целых диапазонов
-
GNU R двоичное выравнивание (BAM), вариант вызова (BCF) или импорт файла tabix
-
BioConductor S4 реализация векторов и списков
-
Контейнер для анализа BioConductor
-
BioConductor - аннотация генетических вариантов
-
Цветовые схемы для дихроматов
-
Функции GNU R от Фрэнка Харрелла
-
Комплект GNU R, обеспечивающий подходящие цветовые палитры
-
Масштабные функции для визуализации
-
r-api-3.4